Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL40Q2TBA0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL40Q2TBA0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms