Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q1T7F1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q1T7F1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q1T7F1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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