Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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