Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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