Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LONRF1Q17RB8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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LONRF1Q17RB8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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LONRF1Q17RB8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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LONRF1Q17RB8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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LONRF1Q17RB8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LONRF1Q17RB8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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