Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPP1Q16831 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms