Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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TNXAQ16473 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TNXAQ16473 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TNXAQ16473 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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