Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNHIT3Q15649 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms