Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF3A1Q15459 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A1Q15459 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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