Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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