Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRRQ15256 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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