Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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