Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KARSQ15046 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KARSQ15046 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KARSQ15046 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KARSQ15046 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KARSQ15046 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KARSQ15046 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KARSQ15046 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KARSQ15046 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KARSQ15046 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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