Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3AQ14563 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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