Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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