Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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