Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PKD2Q13563 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PKD2Q13563 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
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