Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3B2Q13367 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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