Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATMQ13315 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATMQ13315 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATMQ13315 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATMQ13315 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATMQ13315 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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