Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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