Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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