Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 MDM34YGL219C 1380 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 NGL2YMR285C 1548 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 SIS2YKR072C 1689 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 SSZ1YHR064C 1617 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 RAT1YOR048C 3021 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 PBP4YDL053C 558 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 RSM24YDR175C 960 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YOR186WYOR186W 435 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YOR392WYOR392W 444 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MRH4YGL064C 1686 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 CEX1YOR112W 2286 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 EIS1YMR031C 2532 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 CIT1YNR001C 1440 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YGL015CYGL015C 393 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 SDL1YIL167W 633 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 ABM1YJR108W 372 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YKL118WYKL118W 312 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MCR1YKL150W 909 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YNL089CYNL089C 477 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 TPK2YPL203W 1143 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 CTP1YBR291C 900 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 TEF1YPR080W 1377 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 TEF2YBR118W 1377 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 GAL80YML051W 1308 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YPL109CYPL109C 1974 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 FAD1YDL045C 921 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 LSB1YGR136W 726 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 DBP8YHR169W 1296 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 PRP45YAL032C 1140 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YKR041WYKR041W 753 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YLR125WYLR125W 411 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YMR141CYMR141C 309 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 RPA43YOR340C 981 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YRB30YGL164C 1323 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 PSY4YBL046W 1326 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 PPN1YDR452W 2025 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YDL012CYDL012C 324 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YER135CYER135C 393 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 LIF1YGL090W 1266 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 VPS51YKR020W 495 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 AAD15YOL165C 432 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YBR090CYBR090C 369 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 TRK2YKR050W 2670 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 NGL3YML118W 1518 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 RFT1YBL020W 1725 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YKR078WYKR078W 1758 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MNS1YJR131W 1650 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YDR149CYDR149C 708 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 SLD5YDR489W 885 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 ATP18YML081C-A 180 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 TAF14YPL129W 735 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 SRP1YNL189W 1629 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 GPB1YOR371C 2694 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 RGT1YKL038W 3513 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 KRE2YDR483W 1329 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 RTT109YLL002W 1311 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 NEL1YHR035W 1893 nt4.96□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.96□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 GAT2YMR136W 1683 nt4.96□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MUD2YKL074C 1584 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 JIP5YPR169W 1479 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 TSR1YDL060W 2367 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YCL065WYCL065W 369 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 AAD3YCR107W 1092 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RPA14YDR156W 414 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RPL12AYEL054C 498 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 DCS1YLR270W 1053 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 CGI121YML036W 546 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YBL055CYBL055C 1257 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 GRX7YBR014C 612 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RMI1YPL024W 726 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ATG12YBR217W 561 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MEF1YLR069C 2286 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 NRD1YNL251C 1728 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ERG7YHR072W 2196 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 ALG6YOR002W 1635 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SSY5YJL156C 2100 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 CUE2YKL090W 1332 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 HCM1YCR065W 1695 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SNT2YGL131C 4212 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 GCD2YGR083C 1956 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 SPC97YHR172W 2472 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 FOL1YNL256W 2475 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 YRA1YDR381W 681 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 NCB2YDR397C 441 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RPS25AYGR027C 327 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 AIM32YML050W 936 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 RPL15BYMR121C 615 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 CST6YIL036W 1764 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MDL1YLR188W 2088 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 MRH1YDR033W 963 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL1Q12391 GCN4YEL009C 846 nt4.94□□□□□ -1.62
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