Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 GCD14YJL125C 1152 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 FRT2YAL028W 1587 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YAR075WYAR075W 474 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YOR114WYOR114W 885 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 SAS5YOR213C 747 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 CHS3YBR023C 3498 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 OXR1YPL196W 822 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 CHK1YBR274W 1584 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 ROD1YOR018W 2514 nt3.56□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 AAD3YCR107W 1092 nt3.56□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RNH203YLR154C 333 nt3.56□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YBR089WYBR089W 600 nt3.56□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 MAK21YDR060W 3078 nt3.56□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 VPS17YOR132W 1656 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 PAD1YDR538W 729 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 DOG1YHR044C 741 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 EPT1YHR123W 1176 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 TFA2YKR062W 987 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 PFK27YOL136C 1194 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 HHF1YBR009C 312 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YOR238WYOR238W 912 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 USA1YML029W 2517 nt3.55□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 NUF2YOL069W 1356 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 MRPL11YDL202W 750 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YGL082WYGL082W 1146 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 IMP3YHR148W 552 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 LAC1YKL008C 1257 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 GMH1YKR030W 822 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 UNG1YML021C 1080 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 CPR8YNR028W 927 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RPS9BYBR189W 588 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 PIN4YBL051C 2007 nt3.54□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 PEX10YDR265W 1014 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 MTD1YKR080W 963 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 SHH3YMR118C 591 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YMR178WYMR178W 825 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 snR11snR11 258 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RPN4YDL020C 1596 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YML096WYML096W 1578 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RRM3YHR031C 2172 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 HUL5YGL141W 2733 nt3.53□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 STU1YBL034C 4542 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 AHA1YDR214W 1053 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 IZH1YDR492W 951 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 IRC22YEL001C 678 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 ISC10YER180C 804 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 FIP1YJR093C 984 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RPL13BYMR142C 600 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YNL013CYNL013C 378 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 MUM2YBR057C 1101 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 SUT2YPR009W 807 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YPR142CYPR142C 564 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 THR4YCR053W 1545 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 SEC15YGL233W 2733 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 PPQ1YPL179W 1650 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 TSC11YER093C 4293 nt3.52□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 ITT1YML068W 1395 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RPN6YDL097C 1305 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 GSC2YGR032W 5688 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YJR061WYJR061W 2808 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 MSR1YHR091C 1932 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 NHP10YDL002C 612 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RPL1BYGL135W 654 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YGR051CYGR051C 324 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YGR190CYGR190C 366 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YVH1YIR026C 1095 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 IME1YJR094C 1083 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 IMP1YMR150C 573 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 OCA2YNL056W 594 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 OSW1YOR255W 837 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RPL1AYPL220W 654 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 KIN4YOR233W 2403 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 MAL12YGR292W 1755 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 MAL32YBR299W 1755 nt3.51□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 DAN4YJR151C 3486 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 SMC2YFR031C 3513 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 LRS4YDR439W 1044 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YHP1YDR451C 1062 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 BUD16YEL029C 939 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 PMI40YER003C 1290 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 LIF1YGL090W 1266 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YGL214WYGL214W 486 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RPS23AYGR118W 438 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 OMA1YKR087C 1038 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RAD33YML011C 534 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 POP8YBL018C 402 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RUF20RUF20 443 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YNL234WYNL234W 1281 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 MVD1YNR043W 1191 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RPS23BYPR132W 438 nt3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.2 ms