Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms