Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 MIC60YKR016W 1623 nt2.5□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 NUF2YOL069W 1356 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YNR063WYNR063W 1824 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 AKR1YDR264C 2295 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PTM1YKL039W 1572 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YPR148CYPR148C 1308 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 THR4YCR053W 1545 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PEP7YDR323C 1548 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 SHQ1YIL104C 1524 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 MNT4YNR059W 1743 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 NAT1YDL040C 2565 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 WBP1YEL002C 1293 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YGR168CYGR168C 1131 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YHR022CYHR022C 771 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 MRPL49YJL096W 486 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 FIP1YJR093C 984 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YML090WYML090W 387 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 VID27YNL212W 2349 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 FMP25YLR077W 1752 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PGS1YCL004W 1566 nt2.49□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YOR365CYOR365C 2112 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 DAP2YHR028C 2457 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 GRS2YPR081C 1857 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 CET1YPL228W 1650 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 SMC3YJL074C 3693 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YCR016WYCR016W 873 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 OPI6YDL096C 327 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 BUD26YDR241W 288 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 BCD1YHR040W 1101 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YPT35YHR105W 645 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 DCG1YIR030C 735 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 ARG3YJL088W 1017 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 ARC19YKL013C 516 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 SRP40YKR092C 1221 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 MAP1YLR244C 1164 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 GAB1YLR459W 1185 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 ARG80YMR042W 534 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 MTG1YMR097C 1104 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 SHH3YMR118C 591 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 SYC1YOR179C 567 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 RSF2YJR127C 4143 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 GSC2YGR032W 5688 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YKL050CYKL050C 2769 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 NUP85YJR042W 2235 nt2.48□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 NEM1YHR004C 1341 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YPL109CYPL109C 1974 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 TCO89YPL180W 2400 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 EXO5YBR163W 1758 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 MSR1YHR091C 1932 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YDR124WYDR124W 975 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 TRP4YDR354W 1143 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 IZH1YDR492W 951 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PAU10YDR542W 363 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PAU11YGL261C 363 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YHL026CYHL026C 948 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PAU13YHL046C 363 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 POG1YIL122W 1056 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 ENT3YJR125C 1227 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PAU4YLR461W 363 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 MRPS8YMR158W 468 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 RPC34YNR003C 954 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 ATG19YOL082W 1248 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 SUR1YPL057C 1149 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 CSH1YBR161W 1131 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 CUE3YGL110C 1875 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 GYP6YJL044C 1377 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 ALG1YBR110W 1350 nt2.47□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 TSR1YDL060W 2367 nt2.46□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 LCB5YLR260W 2064 nt2.46□□□□□ -2.01
RDS3Q06835 PRM15YMR278W 1869 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 ORC4YPR162C 1590 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 AGE2YIL044C 897 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 YKL162CYKL162C 1209 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 SED5YLR026C 1023 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 YAR075WYAR075W 474 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 RPL19BYBL027W 570 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 YMR310CYMR310C 954 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 YPR078CYPR078C 1119 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 RRP7YCL031C 894 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 OAF3YKR064W 2592 nt2.46□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 TEC1YBR083W 1461 nt2.45□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 STE6YKL209C 3873 nt2.45□□□□□ -2.02
RDS3Q06835 DSS1YMR287C 2910 nt2.45□□□□□ -2.02
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