Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FMODQ06828 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FMODQ06828 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FMODQ06828 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FMODQ06828 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FMODQ06828 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FMODQ06828 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FMODQ06828 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FMODQ06828 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms