Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNG1Q06432 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNG1Q06432 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNG1Q06432 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms