Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EXOSC9Q06265 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms