Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms