Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLOD1Q02809 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLOD1Q02809 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLOD1Q02809 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLOD1Q02809 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLOD1Q02809 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLOD1Q02809 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLOD1Q02809 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms