Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT1Q02742 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT1Q02742 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms