Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHDQ02161 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHDQ02161 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHDQ02161 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHDQ02161 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHDQ02161 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHDQ02161 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHDQ02161 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHDQ02161 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHDQ02161 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHDQ02161 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHDQ02161 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHDQ02161 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms