Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEP78395 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEP78395 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms