Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ASIC1P78348 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms