Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA1P68133 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms