Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL23P62829 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL23P62829 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms