Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS2P61201 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS2P61201 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS2P61201 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS2P61201 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS2P61201 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS2P61201 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS2P61201 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS2P61201 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS2P61201 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms