Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM3BP58499 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms