Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC4P56524 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC4P56524 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms