Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAG2P55895 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAG2P55895 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAG2P55895 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAG2P55895 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAG2P55895 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAG2P55895 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAG2P55895 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms