Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF143P52747 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF143P52747 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF143P52747 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF143P52747 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF143P52747 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF143P52747 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF143P52747 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF143P52747 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF143P52747 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms