Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC2P49815 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC2P49815 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC2P49815 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC2P49815 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC2P49815 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC2P49815 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC2P49815 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC2P49815 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC2P49815 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms