Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUMBP49757 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUMBP49757 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUMBP49757 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUMBP49757 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUMBP49757 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUMBP49757 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUMBP49757 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUMBP49757 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUMBP49757 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUMBP49757 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUMBP49757 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUMBP49757 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUMBP49757 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUMBP49757 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUMBP49757 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms