Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms