Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA4P43694 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA4P43694 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA4P43694 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA4P43694 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATA4P43694 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATA4P43694 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATA4P43694 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms