Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACAA2P42765 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACAA2P42765 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms