Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4AP40617 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms