Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FDFT1P37268 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FDFT1P37268 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms