Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT2P35908 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT2P35908 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT2P35908 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT2P35908 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT2P35908 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT2P35908 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT2P35908 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT2P35908 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT2P35908 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT2P35908 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT2P35908 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT2P35908 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT2P35908 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT2P35908 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT2P35908 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms