Protein–RNA interactions for Protein: P35725

YKL063C, Uncharacterized protein YKL063C, yeast

Predictions only

Length 167 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	P35725	YOR342C	YOR342C	960 nt		3.15	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YBR300C	YBR300C	498 nt		3.15	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	SKN7	YHR206W	1869 nt		3.15	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	AEP3	YPL005W	1821 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	SEC59	YMR013C	1560 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YDL026W	YDL026W	312 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YDR222W	YDR222W	1248 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	MSW1	YDR268W	1140 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	TLG1	YDR468C	675 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YGR026W	YGR026W	837 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	POP6	YGR030C	477 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	TYS1	YGR185C	1185 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	IRC18	YJL037W	675 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	MRPL49	YJL096W	486 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YJR111C	YJR111C	852 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	URA4	YLR420W	1095 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	PFK27	YOL136C	1194 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	GPI2	YPL076W	843 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	OXR1	YPL196W	822 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	DER1	YBR201W	636 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	VPS33	YLR396C	2076 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CTM1	YHR109W	1758 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	STP2	YHR006W	1626 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CLN2	YPL256C	1638 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YPL109C	YPL109C	1974 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	RDS1	YCR106W	2499 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	STU2	YLR045C	2667 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	UBP5	YER144C	2418 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	RPS29B	YDL061C	171 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	DDI2	YFL061W	678 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	ADH4	YGL256W	1149 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	PET54	YGR222W	882 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	ATP12	YJL180C	978 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	FLD1	YLR404W	858 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	DDI3	YNL335W	678 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	BUD21	YOR078W	645 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YBR137W	YBR137W	540 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	BCS1	YDR375C	1371 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	HDA2	YDR295C	2025 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YDR290W	YDR290W	330 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YPT35	YHR105W	645 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	LSM1	YJL124C	519 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	MDJ2	YNL328C	441 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YOR238W	YOR238W	912 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CAF20	YOR276W	486 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	RET3	YPL010W	570 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CMD1	YBR109C	444 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	GRX1	YCL035C	333 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	LTV1	YKL143W	1392 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	RRN6	YBL014C	2685 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YCR015C	YCR015C	954 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	RRP8	YDR083W	1179 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	PEX10	YDR265W	1014 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	BSC2	YDR275W	708 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YDR355C	YDR355C	303 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	SCM4	YGR049W	564 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CDC12	YHR107C	1224 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	BUR2	YLR226W	1188 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YAR075W	YAR075W	474 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	SPO20	YMR017W	1194 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	MRPL51	YPR100W	423 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CHK1	YBR274W	1584 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	ACK1	YDL203C	1872 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	TRM12	YML005W	1389 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	PRP31	YGR091W	1485 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	MIG1	YGL035C	1515 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	FRQ1	YDR373W	573 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	TFA2	YKR062W	987 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	COX19	YLL018C-A	297 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	MOH1	YBL049W	417 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	TIR2	YOR010C	756 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YPR136C	YPR136C	513 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	CDH1	YGL003C	1701 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	STT4	YLR305C	5703 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	RPA14	YDR156W	414 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	KXD1	YGL079W	657 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YIR014W	YIR014W	729 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	ERP1	YAR002C-A	660 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	COS1	YNL336W	1146 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL063C	P35725	PLM2	YDR501W	1566 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL063C	P35725	RAX2	YLR084C	3663 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL063C	P35725	ENT5	YDR153C	1236 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL063C	P35725	AML1	YGR001C	747 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL063C	P35725	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL063C	P35725	RPL13B	YMR142C	600 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL063C	P35725	TEX1	YNL253W	1269 nt		3.08	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.1 ms