Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms